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LABORATÓRIOS DE CIÊNCIAS, FÍSICA E BIOLÓGICAS
A Escola possui quatro laboratórios bem equipados, sendo um de Física, um de Química, um de Biologia e um de Ciências, onde são ministradas todas as aulas das respectivas disciplinas. Além da estrutura física (equipamentos permanentes e materiais para experimentos), os professores contam com o auxílio de um Técnico de Laboratório para o planejamento e preparação das aulas e para o desenvolvimento das atividades práticas.
LABORATÓRIO DE INFORMÁTICA
O Laboratório de Informática da Escola de Aplicação (LIEA) tem sido objeto de constantes discussões com o objetivo de reformular sua organização e garantir que seja um efetivo espaço de ação pedagógica que auxilie os professores na proposição de atividades didáticas.
Com a criação do Serviço de Informática da FE, este laboratório tornou-se um ramal da Seção de Informática. As necessidades de atendimentos técnicos foram transferidas para a Seção de Informática, cabendo a EAFEUSP exclusivamente a preocupação com as questões de caráter pedagógico. Várias aulas das diferentes disciplinas ocorrem nas instalações do LIEA.
Os alunos utilizam o Laboratório de Informática para realização de trabalhos, pesquisa, impressão de materiais no período de aula e no período oposto ao das aulas regulares.
Professores agendam horários e realizam aulas e projetos constantemente neste espaço.